Держводагентство облаштує 4 базові лабораторії. Для отримання достовірної інформації щодо хімічного стану масивів поверхневих вод заплановано покриття 10 % водних масивів для досліджень забруднюючих речовин та визначення хімічного стану.
Буде запущено у роботу ще одну сучасну лабораторію для діагностики реального стану водних масивів на базі БУВР Причорномор’я та нижнього Дунаю;
Лабораторія Дністровського басейнового управління водних ресурсів буде укомплектована додатковими приладами для газової хроматографії. Це дозволить збільшити вдвічі кількість досліджуваних масивів;
У лабораторії Сіверсько-Донецького басейнового управління водних ресурсів протягом 2020 року планують збільшити свої технічні потужності для виконання досліджень завдяки придбаним сучасним приладам;
Також планується відкриття нової сучасної лабораторії Міжрегіонального офісу захисних масивів дніпровських водосховищ у м. Вишгород, яка облаштовується за підтримки проєкту «Водна ініціатива плюс Європейського Союзу для країн Східного партнерства». За оцінкою постачальників обладнання для лабораторії у м. Вишгород, Україна найкраще виконала всі вимоги ЄС до інфраструктури серед інших 6-ти країн проекту.